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The DeepChem library は、創薬、材料科学、化学、生物学におけるディープラーニングの利用を民主化するオープンソースツールを提供します。この W&B インテグレーションは、DeepChem を使用してモデルをトレーニングする際に、シンプルで使いやすい実験管理とモデルチェックポイントを追加します。

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DeepChem のロギングを 3 行のコードで

logger = WandbLogger(…)
model = TorchModel(…, wandb_logger=logger)
model.fit(…)

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Report と Google Colab

W&B DeepChem インテグレーションを使用して生成されたチャートの例として、Using W&B with DeepChem: Molecular Graph Convolutional Networks の記事を参照してください。 すぐに動作するコードを見たい場合は、この Google Colab をチェックしてください。

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実験管理のトラッキング

KerasModelまたはTorchModel タイプの DeepChem モデルに W&B を設定します。

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サインアップと API キーの作成

APIキーは、あなたのマシンを W&B に認証します。APIキーはユーザープロフィールから生成できます。
よりスムーズなアプローチとして、https://wandb.ai/authorize に直接アクセスして、APIキーを生成できます。表示されるAPIキーをコピーし、パスワードマネージャーなど安全な場所に保存してください。
  1. 右上のユーザープロフィールアイコンをクリックします。
  2. User Settings を選択し、API Keys セクションまでスクロールします。
  3. Reveal をクリックします。表示されたAPIキーをコピーします。APIキーを隠すには、ページを再読み込みします。

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wandb ライブラリのインストールとログイン

wandb ライブラリをローカルにインストールしてログインするには：
  • Command Line
  • Python
  • Python notebook
  1. WANDB_API_KEY 環境変数 をあなたのAPIキーに設定します。 
    export WANDB_API_KEY=<your_api_key>
  2. wandb ライブラリをインストールし、ログインします。 
    pip install wandb

wandb login

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トレーニングと評価データを W&B にログする

トレーニング損失と評価メトリクスは、W&Bに自動的に記録されます。オプションの評価は、DeepChem の ValidationCallback を使用して有効化できます。WandbLogger は ValidationCallback コールバックを検出し、生成されたメトリクスをログします。
  • TorchModel
  • KerasModel
from deepchem.models import TorchModel, ValidationCallback

vc = ValidationCallback(…)  # optional
model = TorchModel(…, wandb_logger=logger)
model.fit(…, callbacks=[vc])
logger.finish()
⌘I