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DeepChem 라이브러리는 약물 발견, 재료 과학, 화학 및 생물학에서 딥러닝 사용을 대중화하는 오픈 소스 툴을 제공합니다. 이 W&B 인테그레이션은 DeepChem을 사용하여 모델을 트레이닝하는 동안 간단하고 사용하기 쉬운 experiment 추적 및 모델 체크포인팅을 추가합니다.

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3줄의 코드로 DeepChem 로깅하기

logger = WandbLogger(…)
model = TorchModel(…, wandb_logger=logger)
model.fit(…)

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Report 및 Google Colab

W&B와 DeepChem 사용: 분자 그래프 컨볼루션 네트워크 아티클에서 W&B DeepChem 인테그레이션을 사용하여 생성된 차트 예제를 살펴보세요. 작동하는 코드로 바로 들어가려면 이 Google Colab을 확인하세요.

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Experiments 추적

KerasModel 또는 TorchModel 유형의 DeepChem 모델에 대해 W&B를 설정합니다.

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가입하고 API 키 만들기

API 키는 W&B에 대한 컴퓨터를 인증합니다. 사용자 프로필에서 API 키를 생성할 수 있습니다.
보다 간소화된 접근 방식을 위해 https://wandb.ai/authorize로 직접 이동하여 API 키를 생성할 수 있습니다. 표시된 API 키를 복사하여 비밀번호 관리자와 같은 안전한 위치에 저장합니다.
  1. 오른쪽 상단 모서리에 있는 사용자 프로필 아이콘을 클릭합니다.
  2. User Settings를 선택한 다음 API Keys 섹션으로 스크롤합니다.
  3. Reveal을 클릭합니다. 표시된 API 키를 복사합니다. API 키를 숨기려면 페이지를 새로 고칩니다.

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wandb 라이브러리를 설치하고 로그인하기

wandb 라이브러리를 로컬에 설치하고 로그인하려면 다음을 수행합니다.
  • Command Line
  • Python
  • Python notebook
  1. WANDB_API_KEY 환경 변수를 API 키로 설정합니다. 
    export WANDB_API_KEY=<your_api_key>
  2. wandb 라이브러리를 설치하고 로그인합니다. 
    pip install wandb

wandb login

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W&B에 트레이닝 및 평가 데이터 기록하기

트레이닝 손실 및 평가 메트릭은 W&B에 자동으로 기록될 수 있습니다. DeepChem ValidationCallback을 사용하여 선택적 평가를 활성화할 수 있습니다. WandbLogger는 ValidationCallback 콜백을 감지하고 생성된 메트릭을 기록합니다.
  • TorchModel
  • KerasModel
from deepchem.models import TorchModel, ValidationCallback

vc = ValidationCallback(…)  # optional
model = TorchModel(…, wandb_logger=logger)
model.fit(…, callbacks=[vc])
logger.finish()
⌘I